新品尝鲜丨博奥晶典单细胞Fixed RNA邀请您来体验

单细胞转录组测序在解决组织异质性方面有极大优势，其研究范围和规模扩大的同时，也在样本准备和实验操作等方面面临许多新的挑战。为解决这些难题，博奥晶典引进了 Fixed RNA（RNA 固定）技术。该技术使用多聚甲醛（Paraformaldehyde，PFA）固定组织或细胞悬液，可以在不牺牲完整性或数据质量的情况下，安全地存储和运输样本；此外，利用 Fixed RNA 技术还可实现稳定的混样测序，一次性分析数十万个固定的单细胞，从而为样本获取、管理和处理提供了高效而简化的工作流程，也为通量提高和批量分析创造了新的可能。值得注意的是，Fixed RNA 技术还实现了 FFPE 样本在单细胞水平的研究，可以解锁大量储存在医院以及生物样本库中的 FFPE 样本的宝贵信息。

什么是 Fixed RNA？

Fixed RNA 是采用 4% 多聚甲醛锁定细胞表达状态，通过探针杂交的方式捕获靶基因，再进行细胞捕获建库测序的新技术。该技术解决了脆弱细胞破译、样本储存运输、及多样本批量测序等难题，为单细胞转录组的研究提供便利。

Fixed RNA 的工作流程是怎样的？

组织或细胞悬液样本经多聚甲醛固定后，将样本与探针组杂交，使用 Fixed RNA 专用芯片，单个通道可运行一个样本（单样分析流程），或单个通道中混合多个样本（混样分析流程）。制备单细胞测序文库进行测序，然后使用 10x Genomics 的 Cell Ranger 和 Loupe Browser 软件工具进行分析。

Fixed RNA 有哪些技术优势？

1)保留细胞状态，突破样本限制固定可锁定生物学状态，并保存脆弱或快速变化的细胞。
2)方便实验规划安排可以在不折损数据质量的情况下存储样本，消除时间限制，避免批次效应，减少实验可变性。
3)高灵敏度，数据表现优良采用探针杂交的方式捕获基因，具备单细胞分辨率和高灵敏度，有效数据量、基因表达量及分群结果等与常规单细胞转录组表现一致，且可提高低表达基因的检出率。
4)扩大研究规模降低成本单个通道中可混合多个样本，批量分析、混样处理样本可实现便捷的工作流程、节约成本，效率最大化。

Fixed RNA 技术可以解决哪些问题？

1)取样后需要确定病理以后再决定该样本要不要入组样本需先确定病例分型（如H&E染色、免疫组化等），再根据具体规划确定是否开展单细胞实验。
2)样本本身细胞状态脆弱或转录本易降解将研究对象扩展到脆弱或濒死细胞样本，以及细胞状态短期快速变化，因治疗或扰动而迅速变化，需要研究其变化趋势等，可快速锁定细胞状态。
3)需要多地点取样，或长距离运输样本实验需要多中心合作，或者需从不同地点采样、长距离运输样本等。
4)介意不同批次实验，产生批次效应影响结果生产批次效应无法通过分析层面去除，通过样本的批量处理和混样分析，减少实验可变性并提高效率。
5)需要大样本量、大细胞量，考虑混样测序，但实验成本依然很高大规模研究、队列多中心研究，对样本采集、保存和批量处理有需求，在不折损数据质量的情况下保存样本，在同一次运行中混样测序、批量分析，降低成本。

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