【R语言】如何绘制火山图

火山图在转录组，基因组，蛋白质组，代谢组文章中经常出现，其实火山图是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度和变化幅度相结合，通过不同颜色的散点来表示基因的差异。通常横坐标用log2FoldChange表示，差异越大的基因分布在两端，纵坐标用-log10（p value）表示，T检验显著性P值的负对数。常应用于等统计数据。通常差异倍数越大的基因T检验越显著，所以往往关注左上角和右上角的值。

FoldChange翻译成中文是差异倍数，简单来说就是基因在一组样品中的表达值的均值除以其在另一组样品中的表达值的均值。所以火山图只适合展示两组样品之间的比较。