计算机辅助药物设计及分子动力学

专题一：CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接。生物分子互作基础、蛋白数据库、蛋白结构分析、同源建模、小分子构建、小分子化合物库、生物分子相互作用、虚拟筛选、小分子格式转换、蛋白-蛋白大分子对接、小分子与小分子对接、基于碎片药物设计、构效关系分析

专题二：AMBER分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算：分子力学简介、分子力场、LINUX 简介、AMBER简介和安装、模型文件的预处理、能量优化、分子动力学模拟、焓变计算、熵变计算、3D可视化分析、构象分析、能量分析、经典工作复现

专题三：薛定谔分子对接、药效团虚拟筛选、3D-QSAR化合物活性分析专题：1. 分子对接基础、原理及对接软件介绍；2. 分子对接软件（薛定谔) 使用；3.基于结构的虚拟筛选（薛定谔）；4. 共价对接（薛定谔）；5. 药效团构建虚拟筛选（薛定谔）及结果分析；6. 构效关系模型（3D-QSAR）构建及化合物活性分析

专题课程四：AIDD人工智能（机器学习与深度学习）辅助药物发现专题：计算机辅助药物分子设计；

Anaconda3的安装配置；AIDD简介——分类和回归任务；基于浅层机器学习的药物发现；基于浅层学习的药物发现；基于浅层学习分类的虚拟筛选；基于深度学习的药物发现；使用DNN，GCN，GAT等主流深度学习模型进行实操

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