研究miRNA，到底是研究5p成熟体还是3p成熟体呢？

我们在研究miRNA的时候，比如hsa-miR-296，但在查找序列时，发现有hsa-miR-296有两个成熟体，hsa-miR-296-3p和hsa-miR-296-5p，可是文献中一般只会说hsa-miR-296，这样的话到底是做哪个？是3p还是5p呢？

这里，汉恒生物小编就和大家说说miRNA的3p和5p之间的区别。

首先，什么是miRNA呢？

miRNA (microRNA)是一组由基因组编码的长度约20～25个核苷酸的非编码RNA，通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。在miRNA公共数据库miRBase (http://www.mirbase.org/)中已经有1W多条来自不同物种的miRNA序列。

那它是怎么来的呢？

是由约70个碱基大小形成发夹结构的单链RNA前体 （pre-miRNA），经过Dicer酶酶切加工后，成为长约20~25nt的成熟miRNA，如下图所示：

图1，miRNA结构图

有的miRNA前体两个臂分别产生一条有功能的成熟miRNA，他们分别靶向不同的位点。这时候就要来进行区分了，一般以“-5p”和“-3p”分别命名，如hsa-miR-296-5p和hsa-miR-296-3p，分别表明从hsa-mir-296前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号，而表达水平较低的miRNA后面加上*号，有时带“*”的miRNA就根本不出现。但对于hsa-miR-296-3p和hsa-miR-296-5p则都没有带*号，表明两个成熟体都有可能存在且表达量都不低。

而发夹状结构的miRNA前体转录本以“mir”命名，其编号以“MI”编号，如人的miRNA296的前体ID为hsa-mir-296，Accession为MI0000747。如下图所示。

图2，hsa-mir-296前体

图3，hsa-mir-29b-1成熟体

所以针对最初问题，可以从两个途径来确定：

1. 查文献：

如果参考的文献中有他所用的hsa-miR-296序列或者Accession number，直接拿序列与现在的hsa-miR-296-5p以及hsa-miR-296-3p比较即可，这样最准确；

   2.  查mirbase数据库：

如果参考的文献没有给出具体序列，只是写hsa-miR-296，那上mirbase数据库查hsa-miR-296，虽然他会列出hsa-miR-296-5p以及hsa-miR-296-3p两个不同的miRNA成熟体，但在下面有写Previous IDs，这样就能知道之前的hsa-miR-296是现在的5p还是3p（如上图所示），显然这里是指的hsa-miR-296-5p。

以上就是两个miRNA成熟体的选择方法，如果有其他的疑问，欢迎咨询汉恒生物！