肾透明细胞癌（KIRC）是肾癌的主要亚型。铜死亡和铁死亡与肿瘤的免疫浸润和预后相关。然而，铜中毒相关铁死亡基因 (CRFG) 在 KIRC 中的作用很少被完全了解。因此，我们根据 KIRC 中 CRFG 的不同表达构建了一个预后特征。本研究的所有原始数据均提取自公共 TCGA 数据集。Cuprotosis 和 Ferroptosis 基因是从之前的研究中收集的。最后，从 TCGA-KIRC 队列中总共鉴定出 36 个显着不同的 CRFG。六基因特征（TRIB3、SLC2A3、PML、CD44、CDKN2A和MIOX）是通过基于显着不同的 CRFG 的 LASSO Cox 回归来识别的。CRFG 特征与较差的总体生存率相关，AUC 为 0.750。功能富集表明CRFGs主要富集于代谢、耐药、肿瘤免疫途径。此外，IC50和免疫检查点在不同组间表达存在差异。所提出的 6-CRFG 签名是一种有前景的生物标志物，可预测 KIRC 患者的临床结果和治疗反应。

结果

CRFG 的识别

TCGA数据集中KIRC患者的基线临床情况见表表格1。1。KIRC 非肿瘤组织和肿瘤组织之间总共鉴定出 8515 个 DEG。通过分析铜死亡相关铁死亡基因的相关系数，我们获得了183个铜死亡相关铁死亡基因（p  < 0.001和|Cor|> 0.3）。随后，我们筛选了36个与铜死亡相关的铁死亡差异表达基因。正如预期的那样，铜凋亡相关的铁死亡基因与 KIRC 正常组织和肿瘤组织不同。

建立 CRFG 签名

为了探讨 CRFG 是否与 KIRC 患者预后相关，通过单变量 Cox 回归分析了上述 36 个已识别基因。结果表明，8 个与铜凋亡相关的铁死亡基因（p  < 0.05）与 KIRC 存活相关。随后，利用上述8个预后基因的表达值，通过LASSO Cox回归生成了6个基因的预后特征。 2公元前）。选定的六个基因是TRIB3、SLC2A3、PML、CD44、CDKN2A和MIOX。通过6个预后特征基因的相关系数计算风险评分（表（表2）。2）。风险评分 = (0.1430 × TRIB3 概况) + (0.0296 ×  SLC2A3概况) + (0.3216 ×  PML概况) + (0.1135 ×  CD44概况) + (0.2139 ×  CDKN2A概况) + (-0.0496 ×  MIOX概况)。PPI网络结果显示CD44、EGFR、CA9、HIF1A、SLC2A、VEGFA、CDKN2A、CAV1和MUC1为枢纽基因。然后，将患者分为 KIRC 低组和 KIRC 高组。KIRC 高组的生存结果比 KIRC 低组差。低分组和高分组的签名表达有所不同。1、3、5年OS的ROC曲线分别为0.75、0.675和0.654。同样，该签名显示了验证队列中 KIRC 生存结果的强大预测能力

独立预后因素分析

单变量回归发现分期、年龄、风险评分和等级与 KIRC 患者的生存相关（p  < 0.001）。此外，多变量回归表明年龄、分期和风险评分也与 KIRC 生存相关（p  < 0.05）。这些结果表明，CRFGs 特征可以作为 KIRC 的预后标志物。

特征与临床特征之间的相关性

其中，5 个基因（TRIB3、SLC2A3、PML、CD44和CDKN2A）在 KIRC 高危组中不受调控。MIOX基因在高危人群中下调，可能是一种保护性基因。临床资料分析显示，两组患者的N分期、性别、M分期、T分期及分级均存在差异（P  <0.05）。然而，基于 CRFGs 的签名在 M 期（M0，M1）、T 期（T1-T4）、期（I-IV 期）和 G1-G2 级（G1-G2）的预测结果较差（P > 0.05）。此外，还开发了基于 CRFG 风险评分的列线图作为图形计算器，用于预测 KIRC 患者的预后。列线图具有良好的校准和准确性。因此，列线图可用于 KIRC 患者的评估。

功能丰富

KEGG和GO分析显示内在细胞凋亡、对氧水平的反应、DNA损伤、细胞凋亡、血管生成、营养水平和化学应激显着富集。综上所述，该特征与 KIRC 的生物代谢、耐药性、肿瘤免疫和转移有关。

KIRC-high 和 KIRC-low 的免疫浸润显示在附加文件5中：。ICOS、BTLA、CTLA-4、CD27、CD28、CD40、LAG3、PVR、SIRPA、TIGIT、HLA-DPA1 和 TNFRSF9 的免疫检查点在 KIRC 高组中上调。免疫浸润显示CD44和PML水平与树突状细胞、CD4-CD8+T细胞和B细胞呈正相关。SLC2A3、PML 、 CD44与巨噬细胞、中性粒细胞呈正相关；CDKN2A表达水平与巨噬细胞呈负相关。TRIB3与 CD4-CD8 + T 细胞呈负相关。药物敏感性分析发现，RDEA119、Bexarotene、Bicalutamide、Bortezomib、Cyclopamine、Embelin、Midostaurin、Dasatinib、Thpsigargin、Sorafenib、Salubrinal 和 Obatoclax Mesylate 在低风险组中高于高风险组