百炼成钢 | 同行哭了，迈维单一代谢组学文章突破100！
开学啦！要做的实验，要看的文献是不是该排上日程啦~
近期，小编也对我们的合作客户文章进行梳理，惊讶的发现，登记“在案”的单一组学-代谢组学客户文章已经悄悄破100了，这势必得分享给刚开学的你们，下半年的flag赶紧立起来，比如说读10篇代谢组学的文献。
为了方便大家直接找到与自己研究相关的方向，我们也按照研究方向进行划分，总共划分为6大研究方向：
1.色泽篇
目前研究中与颜色相关的物质主要有四种类型，其中花青素、类胡萝卜素、甜菜色素是大家较为熟知的物质类型，还有一类物质名为橙酮，与花青素同属于类黄酮，但是其相关研究报道较少，因此关注度不如前三类物质：
了解参与颜色形成的三大类物质之后，对于研究所关注颜色可能的相关物质我们就有了初步判断。想要更加深入的设计实验，还是得站在前人的肩膀上学习，效果势必事半功倍，本篇共计带来11篇利用代谢组学技术进行色泽的研究。
部分文章解读链接如下：
项目文章 | 代谢组学分析揭示不同颜色藜麦籽粒中类黄酮和酚酸的积累模式
2.品质篇
与色泽的研究不一样的是，品质的研究范围更加宽泛，从种子或果实的大小到果实的硬度，口味（酸甜苦辣），香气等等，而这些品质也是实际生产中决定消费者喜爱程度的因素，这些品质也与代谢物息息相关。
因此对于不同的品质，可以根据自己的关注内容进行物质查询，物种可以不仅仅限于本物种，可以扩展到其他物种中相关物质的研究，说不定可以在本物种中发现相似功能的物质。本篇共计38篇品质相关研究文章。
部分文章解读链接如下：
项目文章 | 新疆蔷薇果的代谢活性成分及抗氧化活性分析（蔷薇）
项目文章 | 海南地区5篇高水平组学文章合集（黄皮）
又双叒叕2篇！华南农业大学发力代谢组学研究！（枇杷）
项目文章 | 18个红毛丹2篇！果实品质代谢组与味觉标志物分析（红毛丹）
项目文章4篇｜代谢组在铁皮石斛产量和品质研究中的应用（石斛）
项目文章 | IF=6.3 ！12个样品代谢组数据揭示不同品种糜子抗氧化的差异（谷子）
地道寻茶记 | 代谢组揭秘16种武夷岩茶香气四溢的物质基础（茶叶风味）
项目文章 | 关于水果果实品质风味的多组学研究文献合集（刺梨）
3.生长发育篇
植物的生长发育是一个复杂且长期的过程，这个过程中涉及到植物的营养生长和生殖生长两个主要阶段，在生长发育中，学者们一直都比较关注初生代谢物的变化，这主要是由于初生代谢物糖、氨基酸、脂质等参与了能量代谢，而有机酸参与了TCA循环的原因。
近些年来，对于在生长发育过程中次生代谢物的变化也引起了学者们的关注，次生代谢物不仅仅是在植物的防御过程中发挥作用，在植物的生长中发现可以作为植物生长调节剂，从而为生长防御模式增加了另一层调控[1]。例如在拟南芥中，脂肪族3-羟丙基硫甙葡萄糖苷通过完整的雷帕霉素靶通路在生理浓度下抑制根系分生组织的生长[1]，此外硫甙葡萄糖苷还可能调节生物钟和开花时间[2]。
除了这些，在生长发育过程中ROS的变化也逐渐进入大家研究的视野，从非生物胁迫中我们知道，ROS的过多产生会导致细胞程序性死亡，而ROS又是有氧反应的产物，因此在生长发育过程中也不能存在过量的ROS，因此必然存在抗氧化的物质用于保持ROS的平衡[3]。
本篇一共16篇相关研究文章，涵盖种子萌发、种子休眠、腋芽生长、花芽发育、花发育、果实成熟各个阶段。
部分文章解读链接如下：
项目文章2篇 | 相同样本，不同组学手段在白菜细胞质雄性不育中的研究（白菜雄性不育）
项目文章 | 脂肪酸输出蛋白BnFAX6促进侧芽生长的功能机制（油菜腋芽）
4.非生物胁迫篇
与动物或者人不一样，植物在面临复杂且多变的生存环境时无法通过移动去避免环境压力带来的影响，因此植物必需在短时间内感知并响应这些变化，使它们可以生存以及繁殖。在感应外界环境变化的方面，通常只有植物的一小部分先于其他部分感知到环境条件的变化，这部分感知组织会产生系统信号，该信号传播到其他组织部位，触发这些组织部位的适应和防御机制，这种“系统性”的变化会帮助植物更好的适应未来环境的变化。参与这种反应的感知组织被称为“局部”组织，其余的部位被称为“系统”组织。研究表明，在许多类型的应激中，包括非生物条件，如光应激、机械应激和温度应激，以及生物应激，如细菌、真菌和病毒感染，系统反应越快，植物就越有机会适应和防御即将到来的非生物或生物挑战[4]。
抗坏血酸（AsA）、谷胱甘肽（GSH）、a-生育酚、氨基酸（如脯氨酸）、糖、类胡萝卜素和奎宁酸衍生物（如绿原酸）被认为是在植物中起作用的抗氧化剂；然而目前还不清楚为什么植物会产生如此多种多样的抗氧化剂。随着具有抗氧化活性的代谢物的积累，非生物胁迫也诱导产生各种特化代谢物，也有人认为根据皂苷、硫甙葡萄糖苷、酚酰胺、苯丙素和黄酮类化合物其在体外抗氧化活性，在体内也具有抗氧化作用[5]。
本篇一共18篇相关研究文章，包括研究最为关注的干旱、高低温、盐碱胁迫、营养胁迫等类型。
部分文章解读链接如下：
客户文章 | 广泛靶向代谢组告诉你盐胁迫下盐地碱蓬的坚强（盐地碱蓬盐胁迫）
项目文章 | 郑果所焦中高老师团队发表樱桃采后UV辐射研究成果（樱桃UV-C处理）
项目文章 | 基于代谢组解析菊芋幼苗对干旱胁迫的响应机制（菊芋干旱）
5.生物胁迫篇
植物是微生物、线虫、昆虫和各种动物，甚至是其他植物的宝贵食物来源和庇护所。与一些细菌、真菌和线虫的相互作用会破坏植物的生长和发育，导致疾病。与细菌和真菌的其他相互作用可以使植物受益，从而促进生长，并在具有挑战性的环境条件下具有更好的恢复力。寄生植物会耗尽宿主的营养，导致生长发育不良。植物在这些相互作用中不是被动的参与者，它们产生大量的信号和生物活性分子，可以帮助确定给定相互作用的结果。这些化合物可以在局部起作用，也可以释放到土壤中，运输到远端组织，以警告感染，甚至分泌到空气中，以影响昆虫的食性和行为，或向邻近植物发出信号[5]。
对植物-生物相互作用机制的深入理解揭示了叶绿体是介导这些相互作用的众多分子和信号的来源。其中一些是叶绿体的直接产物，如糖、氨基酸和根系分泌物中的抗菌素，而另一些则是叶绿体代谢的副产物，如通过调节核基因表达来调节防御反应的逆行信号。
我们会发现，与非生物胁迫一致的是，生物胁迫一起的系统信号也包括激素、ROS等反应，不同的是，除了植物本身积累代谢物用于抵抗生物胁迫以外，植物还会释放出物质到空气中，用于警示临近的植物或者保卫自身。因此在进行生物胁迫的研究中，利用代谢组进行检测时我们则可以考虑同时检测非挥发性和挥发性的物质。
本篇共计带来4篇利用单一组学技术代谢组学的相关研究文献，主要覆盖两大生物胁迫领域抗虫和抗病。
7.食品加工保鲜篇
食品在加工、运输和保藏过程中，常常由于受到氧气、微生物、温度、湿度、光线等因素的影响，而使食品的色、香、味及营养发生变化，甚至导致食品败坏，降低食品的食用价值。因此，如何尽可能地保存食品原有的优良品质特性是食品加工，运输和保存过程中的一个重要问题。而在食品这些不同的变化中，其本质影响的是其中成分的变化，例如储存时间过长，味道发生改变，主要是由于香味物质的减少，而异味物质的增多，因此不管是保鲜还是加工都能充分利用代谢组学技术解析其变化的原因。
本篇共计带来23篇加工保鲜研究，物种覆盖我们日常常见的水果、饮品、粮食作物等。
部分文章解读链接如下：
真香！6个样本测广靶见刊FC（蜂蜜发酵）
项目文章|农产品加工代谢组-板栗钙化研究（板栗保鲜）
项目文章 | 代谢组学揭示花生在烘烤过程中代谢物的动态变化（花生加工）
项目文章 | 王炸！迈维代谢助力合作单位连发三篇高水平茶叶研究文章！（黑茶发酵/绿茶加工/普洱茶加工）
项目文章 | Food Chem两篇！杏子和荸荠代谢组研究（荸荠加热）
项目文章 | 广靶助力白牡丹茶不同藏期品质研究（白茶储藏）
项目文章 | 脂质组学助力油脂加工研究（榛子加工）
项目文章 | 脂质组解析低温缓解菠萝果实内部褐变的机制（菠萝储存）
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参考文献：
1.Erb M, Kliebenstein DJ. Plant Secondary Metabolites as Defenses, Regulators, and Primary Metabolites: The Blurred Functional Trichotomy. Plant Physiol. 2020 Sep;184(1):39-52.
2.Malinovsky FG, Thomsen MF, Nintemann SJ, Jagd LM, Bourgine B, Burow M, Kliebenstein DJ. An evolutionarily young defense metabolite influences the root growth of plants via the ancient TOR signaling pathway. Elife. 2017 Dec 12;6:e29353.
3.Tsukagoshi H. Control of root growth and development by reactive oxygen species. Curr Opin Plant Biol. 2016 Feb;29:57-63.
4.Fichman Y, Mittler R. Rapid systemic signaling during abiotic and biotic stresses: is the ROS wave master of all trades? Plant J. 2020 Jun;102(5):887-896.
5.Nakabayashi R, Saito K. Integrated metabolomics for abiotic stress responses in plants. Curr Opin Plant Biol. 2015 Apr;24:10-6.
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