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原创 小果 生信果

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（56线程，256G内存，个人存储1T）

• 今天小果想要学习用EDTA（Extensive de-novo TE Annotator）进行重复序列注释，在注释之前需要先安装，小果是利用miniconda进行安装的，经过一番努力后终于安装成功了！让我们看看安装步骤如何吧：

下载miniconda安装包

官网：Miniconda — conda documentation

北外镜像：Index of /anaconda/miniconda/ | 北京外国语大学开源软件镜像站 | BFSU Open Source Mirror

注意要选择适合自己的版本哦。

wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py310_23.1.0-1-Linux-x86_64.sh

wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

下载完安装文件就可以开始安装了！

在文件的下载目录下直接输入：

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

在这一过程中会出现阅读license的请求，一直按enter继续或者q退出都可，最后同意条款，输入yes继续

接着会出现选择安装目录，可以按enter默认安装路径，或者ctrl-c结束安装，或者直接输入新的安装路径改变安装位置。

继续yes

结束后测试一下安装，输入conda list

呀，小果发现conda命令无法被找到

不要慌，可能是因为conda环境路径没有被正确地添加到系统的环境变量中，可以输入以下命令来添加环境变量：

export PATH=＂/home/hui/miniconda3/bin:$PATH＂

其中/home/hui/miniconda3/bin是我们的miniconda安装路径，小可爱自行修改哦。

输入echo $PATH打印出当前的PATH环境变量值，检查是否成功将路径添加到环境变量中，可以看到其中已经包含了miniconda的安装路径

　再次输入conda list，成功~

接下来我们安装一下conda的channel方便安装各种其它实用的生信软件。

这里安装了两个channel.

官方：

conda config --add channels bioconda

conda config --add channels conda-forge

镜像：conda config --add channels

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --set show_channel_urls yes

通过conda config --show channels查看当前已添加的conda channels列表，如图成功安装，其中defaults为官方自带的channel.

或者（镜像）

好啦，接下来我们就可以安装EDTA了！关注小果，更多生信干货下期见~

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