尔云间生信代码|9+SCI纯生信,模型构建中的“流量明星”,你不得不知的LASSO
小云编发现近年来,LASSO应用程度较广。已有大量研究将LASSO算法应用于生信文章,有高到20分的SCI。今天,小云给大家分享这篇影响因子 > 9分简单纯生信文章的代码。
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LASSO回归的特色:一是对数据的要求是极其低的,无论是一维连续因变量、多维连续因变量、非负次数因变量、二元离散因变量、多元离散因变,此外,无论因变量是连续的还是离散的,LASSO都能对其处理。二是LASSO能够对变量进行筛选和对模型的复杂程度进行降低。而变量筛选是指把所有的变量都放入模型中进行拟合,而是有选择的把变量放入模型从而得到更好的性能参数。 复杂度调整是指通过一系列参数控制模型的复杂度,从而避免过度拟合。
LASSO的复杂程度由λ来控制,λ越大对变量较多的线性模型的惩罚力度就越大,从而最终获得一个变量较少的模型。我们可以通过尝试若干次不同值下的λ,来选取最优λ下的参数。
小编发现近年来,LASSO应用程度较广。已有大量研究将LASSO算法应用于生信文章,有高到20分的SCI。如下图。这篇影响因子 > 9分简单纯生信文章。

但是具体要如何实现??? 今天,小云以代码提供的数据为例进行说明。
代码具体包括:
Step1输入数据并构建LASSO
Step2 CV交叉验证
Step3最佳组合的筛选与绘图
下面是代码中附带数据逐步分析结果


神奇吧,就是如此简单,我们用的都是入门级函数,稍微懂点R语言就能实现。
.这是小云做的LASSO回归模型构建,也可以按照粉丝的要求复现哦,扫码找我。

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