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关系乱如网,其实一眼清,网络图解读

2023-02-27 09:23 作者:小云爱生信  | 我要投稿

尔云间  一个专门做科研的团队

原创 小果 生信果


小伙伴们大家好啊,想必大家经常遇到网络图吧,它们多种多样颜色,大小,样式,五花八门,很是让人头疼,今天小果就带大家来看看网络图吧。


网络图是自定义性比较强的图,一般使用Cytoscape进行构建和美化,因为是自定义的,所以需要结合图下面的标题和注释来看。


比如说上面这张图,点的大小表示连线度,颜色表示上下调,黄色上调,蓝色下调,线条表示相互作用,线条越多表示基因在网络中越重要。


这是子网络,和总网络一样,点越大越关键。


许多网络图下面都有这么一张图,这是韦恩分析的图,作用与韦恩图类似,也是起一个取交集的作用,通过对网络的拓扑性质取交集来筛选关键基因。比如说其中的Degree是连线数,其余数据也都是反应基因节点关键程度的。


上面的都是蛋白互作网络图,接下来看一下靶基因和miRNA的互作图

这上面红色三角表示miRNA,圆形表示基因,颜色表示上下调,线条就表示基因和miRNA之间的关系。


类似的还有转录因子网络,上图中黄色三角是转录因子,红色椭圆是靶基因,箭头由转录因子指向靶基因,表示转录因子调控靶基因。


总而言之,网络图并不复杂,只要仔细看一下图片的标题和注释,图片信息基本就都掌握了。好了,今天的主要内容就是这样了,小伙伴们有什么问题欢迎来和小果分享讨论哟。



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