空间代谢组分析内容解析（数据挖掘必看）

空间代谢组学可开展生物组织中代谢物成像与原位分析，有利于掌握机体生理或病理相关的代谢物变化规律和时空分布特征，能深层次地理解其在生命活动及病变过程中的作用和机制。空间代谢组学首先可得到物质的分布信息，然后根据物质分布信息对组织区域代谢特征进行划分，并寻找不同区域特征代谢物，以解释生命活动机理。接下来我们看下空间代谢组的核心结果展示。

01·HE&离子成像图&SSCC

样本HE染色图，不同离子模式成对离子的成像图，单样本水平降维聚类cluster图。

02·成对离子MSI合并图

前体离子与其代谢产物的比例图，图中区域颜色越亮，前体离子的表达水平越高。

03·差异代谢物SSCC

所有样本和单样本水平，差异代谢物降维聚类可视化图形。all-cluster，所有样本的像素点按照聚类的cluster区分；all-sample，所有样本的像素点按照样本名区分；sample1，单样本水平按照聚类的cluster区分。

04·差异代谢物大类热图

两个比较组间，差异代谢物按照Fold Change 值绘制热图。横轴色块显示差异代谢物的Super Class类别，纵轴色块显示像素点所属区域信息及不同比较组。差异代谢物按表达值横聚类绘制热图。横轴色块显示差异代谢物的Super Class类别，纵轴色块显示像素点所属区域信息及不同组别。

05·WGCNA

特征离子聚类树及对应模块；特征离子模块及性状关联分析。

06·circos差异代谢物相关性环图

不同颜色显示代谢物Super Class信息，点的大小显示Fold Change值，线的颜色显示相关性系数的大小。

07·KGML网络图

圆为不同的代谢物；三角为与代谢物有显著相关性的蛋白；方块为代谢物&蛋白富集到的通路信息；菱形表示与代谢物有相互关联的外源性代谢物。红蓝两色表示上下调的信息。点的大小为节点之间的连接度。

优质的空间代谢组

定性算法经过多维校准

定性结果同时考虑物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性、非靶向质谱数据和空代自建数据库进行校准。

项目实测结果

可实现定性代谢物数量：1000-3000个代谢物

定性代谢物类型:70%为700Da以下的小分子物质，30%为脂质大分子

本期的高分辨率空间代谢组学分析篇—质谱成像与空间成像分析到这里就结束啦，后续基于不同领域及方向的空间代谢组鹿明将有一系列，进一步解读更多空间代谢组学方法和结果，干货多多，请不要错过！

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