尔云间  一个专门做科研的团队

原创 小果 生信果

各位小伙伴们，大家好呀，我是你们的老朋友小果，最近收到许多粉丝朋友的留言，说是不知道怎么下载TCGA中的突变数据，为此小果今天特地为大家带来TCGA下载突变数据教学。接下里就跟随小果一起去看看吧。

小果在这里以下载肝癌LIHC的突变数据为例，进行演示，下载步骤如下：

1. 进入官网GDC，在搜索框中输入LIHC，选择TCGA LIHC搜索

2. 查看搜索结果，在Data Category下点击simple nucleotide variation后面的数字375，进入单核苷酸突变数据页面

3. 在单核苷酸突变数据页面点击FILE，Data Type选择masked Somatic Mutation ，Access下选择open，点击Add ALL File to Cart

4. 点击完后，查看Cart中的数据情况，点击Downloads选择Cart进行数据下载，这样数据就会下载到本地了

好了以上就是小果的分享，小伙伴们快去实践下吧。

推荐阅读

• GEO数据到底需不需要标准化，看这里
  

• miRNA靶基因的集大成者，miRWalk数据库
  

• 不做实验也能看到的显微图像，HPA数据库
  

• 简单使用ICGC数据库进行数据查询与下载
  

• 铁死亡基因的专属仓库，FerrDb数据库

shengxinguoer

生信果

生信硬核知识解答

和小果一起学生信