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MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的患者人口统计学指标

2023-07-24 11:59 作者:水无浅痕  | 我要投稿

在上一篇数据库提取教程中,小编教大家提取了“肺栓塞”患者的实验室指标,具体步骤可以参考MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的实验室指标。

在本期数据库提取教程,小编依旧以“肺栓塞”患者为例,教大家如何提取患者的人口统计学指标。

在mimiciv数据库中,患者的人口统计学信息主要分为两部分。

第一部分为患者的“语言”,“种族”,“婚姻状态”这几种信息,这些信息直接记录在了hosp模块的admissions表中,大家直接提取即可。

第二部分为患者的“年龄”,“身高”,“体重”这几个信息,这几个信息都不可以直接从表中直接提取,而是要经过计算才能获取患者正确的指标。

本期小编就教大家如何在mimiciv数据库中获取患者的“年龄”,“身高”,“体重”这几个很重要的指标。

一,获取患者的真实年龄

mimiciv数据库为了保护患者的隐私,并没有直接记录患者的真实年龄,patients表中记录了两个关于年龄的字段:

anchor_age:患者相对anchor_year的相对年龄。

anchor_year:计算患者年龄的基准年份。

anchor_age并不是患者的入院时的真实年龄,而是根据anchor_year做了偏移,真实年龄的计算公式是:

患者的真实年龄=anchor_age+患者的入院时间-anchor_year

上图中的ROUND函数是将年龄转为2位小数。

上图小编使用到了DATETIME_DIFF函数,该函数为mimiciv官方函数,作用是求两个时间的差,这个函数小编是安装在mimiciv_derived模块中,如果大家不是安装在这个模块中,请把函数前缀替换成自己的模块名哈。


二,获取患者的身高

mimiciv数据库中患者的身高数据存放在icu模块的chartevents表中,并且身高会使用两种单位进行记录,分别是英寸跟厘米,为了数值的正确,必须将单位统一,这里小编会将使用英寸的测量数据转成厘米。



三,获取患者的体重

mimiciv数据库中患者的体重数据也存放在icu模块的chartevents表中,患者的体重数据有两种类型,分别是入院时测量的体重跟医院每天的测量体重。小编这里取的是患者两种体重的平均值。

最终提取出来的“肺栓塞”患者的人口统计学信息如下,小编为了大家学习的连贯性,直接把人口统计学指标加在了原有的指标上面。

关注公众号“科研收录”,后台回复“人口统计学”,即可下载教程中完整的SQL脚本,如果大家在学习的过程中有遇到关于mimic数据库的问题,请在后台给小编留言。


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