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科研代码分享|你还在用散点图来可视化数据之间的相关性?

2022-05-31 16:01 作者:尔云间  | 我要投稿

科研有捷径,输入代码,一键获取科研成果!就是这么省事,来具体看下有多方便!

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真香提示:文末可以知道如何获取代码~  

提到相关性,小伙伴们是不是第一反应就是下边这些平平无奇的散点图,一眼望过去,小编觉得SCI又无望了!

直到小编看到了下边这张花里胡哨的网络图,就沉迷于由这个细胞“编织”的“人际关系”了。

此图来自文献

自从看到这张网络图,小编检索了大量的文章,发现有好多文章已经利用了该图,有的不只利用细胞,还对基因进行了“人际关系分析”可视化,比如下边这篇文章就对m6A调节因子之间进行了相关性可视化

细心的你肯定会发现这个网络图中反应的信息居多,比如节点的颜色代表细胞所属的cluster,节点的大小代表生存分析的log_rank_p,用圆心点的颜色展示HR,连线颜色代表正/负相关,连线的粗细代表相关性Pvalue,对于一张图就能折射出大量的有用信息,你们难道不心动吗?

因此,小编又贴心上线整理了代码哟,该流程要求用户提供两个输入文件,一个是细胞在各个样本的浸润水平,另外一个就是细胞属性文件,这里小编用的是细胞的生存分析结果,大家也可以整理其他属性进行绘制哟。整理好文件后,就可以利用该程序运行了。当然这里小编模拟的是细胞,大家也可以基于基因表达矩阵进行基因间的关系探索哟啦

附件包括了:示例数据文件夹:里边是本次流程的输入文件

代码测试文件夹:里边是本次分析用到的代码

输出结果文件夹:里边是本次流程生成的示例图片

readme.txt文件:是对输入文件的说明

以下是该流程分析出来的图片,大家后期可以用AI调整下文字间距哈~

如需代码及示例数据等文件,请扫码聊天框回复“B10”领取! 


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