最终幻想XIV主线剧情——5.X主线（四）自由世代
寻回真心！末日之云散布于北方（5.4另一个未来 5.5死斗至黎明 主线任务剧情）
自由世代
自从回到原初世界后，拂晓血盟伙伴们的身体也逐渐恢复，也差不多该投入到各地的任务中来了。现在帝国局势更加复杂，桑克瑞德和于里昂热打算再潜入帝都搜寻情报。莉瑟也回来看望大家了，光之战士也把古·拉哈·提亚和第一世界的故事详细说给她听。瓦厉斯死后，以他堂弟涅尔瓦为首的贵族开始争权夺利，帝国陷入内乱，这反而给艾欧泽亚同盟军喘息的时间，莉瑟此次前来也是来邀请拂晓血盟参加会议商讨接下来的策略。阿莉塞不打算去开会，就像在第一世界担忧着哈尔里克，阿莉塞一直牵挂着嘎埠，为此她一定要研究出解除精炼的方法。阿莉塞邀请光之战士随她同去，古·拉哈·提亚也要跟着光之战士冒险。
说到研究蛮神，最权威的还是古代亚拉戈帝国的魔科学研究所，但魔大陆不是随随便便就能去的。没想到塔塔露还有杀手锏，在这段时间里她联合其他石之家的成员打造了飞空艇“鸿运号”。三人乘着鸿运号进入了魔大陆，这里确实曾有个叫“欧温”的人写过一篇研究精炼的论文，但具体内容已被删除。凭借水晶塔中的知识和亚拉戈的血脉，古·拉哈·提亚很快就找到了备份论文的情报系统，这次冒险也让他想起了当时探索水晶塔时和光之战士邂逅的经历。情报系统设置了密码，三个人接连猜了几个密码都没有成功，只能先带情报系统回石之家找西德破译。
回到石之家，可露儿也简述了会议上的内容：涅尔瓦是目前势力最大的贵族，他背后是帝国第三军团和朝阳、夜露当年所在的布鲁图斯家族。而艾欧泽亚各国准备趁此机会与各蛮族和解，先解决内部问题，阿莉塞研究解除精炼的方法或许也能对此有所帮助。
西德带来了魔导终端，用暴力穷举的方法很快就破解出了密码“自由”。欧温在论文中详细解释了精炼的原理：被精炼者的以太会向着蛮神自身的属性改变，同时稳定的灵极性增加，若是被深度精炼将会变成形似蛮神自身的异形怪物。欧温原本想继续研究解除精炼，但当时的天才科学家亚蒙并不认可这篇研究的价值，最终石沉大海。
精炼本质是灵魂趋于停滞，这个猜想确实没错。阿莉塞的使魔安杰洛已经可以使灵魂活性化了，但也不能直接增加活性，否则只会增加信徒对蛮神的信仰。光之战士和古·拉哈·提亚想到，用传承记忆的法术来唤醒信徒的自我意识，只不过传承记忆的秘术在第一世界也没有研究出来，最后还是直接用了古·拉哈·提亚的血液。古·拉哈·提亚认为到了原初世界就有希望了，办法就是利用情报系统的模拟魔法功能再加上魔导终端的演算能力，只是要演算的数据极大，需要的魔导终端也极多。但就像加隆德炼铁厂的社训“技术是为了自由而存在”，古·拉哈·提亚也不想辜负欧温的自由之心。听到这句话，西德让比格斯和魏吉把能用的魔导终端都搬来，光之战士等人去找能源和冷却剂。光之战士在伊修加德遇见了艾默里克议长，他们已经邀请瓦努族前来参观商谈。就是现在到了对抗帝国的关键阶段，却很久没见到埃斯蒂尼安了。听闻拂晓血盟现在的工作，艾默里克批了许多青磷水给光之战士。
尼禄不知道从哪里出现，也来帮忙参与研究，听说在第八灵灾发生的未来，是他和西德一起发展出了穿越时空的理论，现在他也要超越自己，研究出亚拉戈帝国都不曾取得的成果。西德也根据水琴的理论和博兹雅的经历，将探觉石的治疗功能加入到了演算中。光之战士、尼禄、西德、比格斯和魏吉还有古·拉哈·提亚，这和当年探索水晶塔的诺亚何其相似。演算即将完成，但机器也面临过载，好在演算最后出现了结论，古·拉哈·提亚也迅速记住了术式。
三人来到利姆萨·罗敏萨，准备试试看能不能救治嘎埠，正好遇到了参加完会议的阿尔菲诺和雅·修特拉。于是，阿尔菲诺和雅·修特拉向古·拉哈·提亚传输魔力，古·拉哈·提亚则转移记忆的魔法给使魔安杰洛。一段时间过后，嘎埠终于找回了自我。虽然大家都耗费了大量魔力，但能够救回那些被精炼的人，这一切也值了，只是那些被深度精炼以至于变异的人是无药可救的。嘎埠只是众多被精炼的其中一个，要展开大规模的治疗必须量产仙子猪使魔，雅·修特拉提议去找使魔方面的专家，也就是真正的魔女玛托雅。
阿尔菲诺总是在某些地方特别天真，他当面说出了雅·修特拉在第一世界自称玛托雅的事。在使魔这方面，玛托雅确实老道，直接就想到了让使魔生产使魔的主意。一行人进入了玛托雅的工坊，再次收集了土、水、火三种材料，将材料投入魔女的锅炉后，一只巨大的仙子猪出现了，这就是仙子猪之母。再次消耗大量魔力后，仙子猪之母开始源源不断生产处带有术式的小猪。
利姆萨·罗敏萨这边，梅尔维布提督正在和鱼人族、地灵族的代表商谈，光之战士一行人也把解除精炼的研究报告给了她。蛮神问题归根结底还是各种族的生存空间问题，梅尔维布就是在会议上提出对蛮族和平政策的人，但与蛮族和解，一定程度上就会限制人类的利益，利姆萨·罗敏萨三大海盗之一的断罪党最近换了新首领，已经因此不出席提督的会议。断罪党不同于另外两个海盗集团，依旧过着劫掠帝国船只的生活，但最近帝国内乱他们的来源也断了。阿尔菲诺听说断罪党反而出手更加阔绰，相应地，蛮族召唤蛮神的水晶却突然减少。光之战士一行人潜入了断罪党的交易地点，他们的水晶果然是从地灵族那里抢来的。一行人转身却发现断罪党的新首领希卡尔多就在背后，希卡尔多直接把话说明白了，现在帝国没法抢，而地灵族用水晶召唤蛮神，抢劫他们本来就合情合法，有何不可？古·拉哈·提亚质问希卡尔多为什么不直接在会议上和梅尔维布提督说？希卡尔多则让光之战士等人转告提督，请她直接到断罪党的船上来谈。
希卡尔多认为，利姆萨·罗敏萨以海盗立国，如今的政策无疑是自弃立国之本。但以梅尔维布提督来看，曾经他们侵吞土地、劫掠异国是为了生存的无奈之举，但时代正在变革，随着帝国崩塌，和平的时代终将到来，利姆萨·罗敏萨应该发挥航海的优势与越来越多的独立国家开展贸易，而地灵族、鱼人族也将是利姆萨·罗敏萨这艘巨舰上的新船员。希卡尔多说不过梅尔维布提督，但海盗和海盗之间只能用海盗的方式一决高下，两人背对背拔枪，第一发子弹互相碰撞弹开，梅尔维布提督的第二发子弹击中了希卡尔多的膝盖。希卡尔多还是不愿意承认失败，还想再战，这时老首领希尔菲厄打落了他的枪。希尔菲厄认为海盗绝不是犯罪分子而是向往自由之人，他们这些海盗将会追随在梅尔维布提督这个船长身边，一起终结旧时代。
解决了国内的问题梅尔维布提督也开始准备和地灵族和解，她向光之战士等人坦言，五十年前利姆萨·罗敏萨确实与地灵族签订过条约，但模糊不清的领土边界反而激化了冲突一直到现在。解除精炼可以唤回地灵族的理智，但要达成真正的和解还要好好去谈，为了逼对方的高级教士出现，梅尔维布提督亲自来到地灵族的火山。教士受精炼的程度极深，听不进任何话，大家全都贡献上了自己的魔力才终于把他的精炼解除。嘎埠出现在教士面前，请求他不要再召唤泰坦了。教士意识到了自己献祭同族的行为，但对于弱小的地灵族来说，为了对抗人类，请神是他们唯一的手段。梅尔维布提督承认，过去人类确实侵占了地灵族的土地，但在未来，她会严格执行条约惩戒那些违反的人，并且利姆萨·罗敏萨将会把地灵族采掘的矿石和打造的金属展现给全世界，国外的优质资源也可与地灵族交易。为了证明自己的真心，提督把佩枪交给了教士，以自己的性命做担保。虽然人类过去屡次伤害地灵族，但如今教士还是选择相信梅尔维布提督，再给人类一次机会。和解终于达成，今后也会再派出人手治疗被精炼的地灵族。
一行人刚准备离开，黑涡团的军官报告说附近突然出现了黑色的高塔，不只是拉诺西亚，世界各地都出现了黑色的塔。这个时间出现异常，绝对和加雷马帝国脱不了干系，最靠近帝国的阿拉米格已经进入最高戒备状态，光之战士等人也马上赶往那里。
一个人带着形似巴哈姆特的巨龙飞过阿拉米格的上空，降落在了空中庭院。光之战士见到了这个形似朝阳的人，但见过了无影的伎俩，大家都猜到他也是占据了朝阳的身体。他是无影法丹尼尔，自称终末使徒，他要让毁灭远古真世界的末日灾难重新降临，他要看着这个世界燃烧，他要见证包括他自己在内的所有人的死亡，他以此为乐，他今天带着真月巴哈姆特前来只为了发表他疯狂的宣言。另外他还告诉光之战士，芝诺斯希望用末日灾难来引出光之战士，只为了和他的挚友一战。
黑色的异形之塔现在交给各国军队调查，光之战士等人回到石之家和雅修特拉汇合。雅修特拉把仙子猪交给了乌尔达哈方面，乌尔达哈也在推进和蜥蜴人族的和解，但就在最近蜥蜴人族被大规模绑架。至于真月巴哈姆特，可露儿和塔塔露准备去联系对龙的专家埃斯蒂尼安。
莉瑟派去调查黑色异形之塔的部队只回来了一个人，他的眼睛散发出幽蓝的光芒，重复地呢喃着：“加雷马帝国万岁……”
法丹尼尔向芝诺斯报告了他和光之战士的相遇，而对芝诺斯来说，当初夜露献上的武士刀天羽羽斩确实是一把好刀，但现在已经配不上他了，接下来他将去挑选能与他的挚友相匹配的武器……
