小云的单日小技巧DAY9:850K甲基化数据的免疫浸润分析很难吗?
850K甲基化芯片相对于450K甲基化芯片来说,具有更高的覆盖度和更好的分辨率。它检测的位点数量是450K的两倍以上,可以检测到更多的CpG位点和其他类型的位点。另外,850K芯片还能够覆盖更多的基因,因此在免疫浸润分析中,可以更全面地评估基因和免疫细胞之间的关系。上一期小云分享了云生信平台(云生信 - 学生物信息学 (biocloudservice.com))450K甲基化数据的免疫浸润分析方法,本期跟小云一起看看850K甲基化芯片的吧。
【上传数据】
1、Group.850.csv(分组信息)

2、methylation850.csv(不同样本各甲基化位点得分)

【输出结果】
1. Wilcox.result.csv(包含了经过 Wilcoxon rank-sum test 检验的差异甲基化位点的统计信息)

2. Immune.infiltration.result.csv(包含了不同类型免疫细胞浸润得分)

3. B.pdf

4. meth.DMP.results.csv(差异甲基化位点的分析结果)

5. Neutro.pdf

6. Eosino.pdf

7. CD4T.pdf

8. NK.pdf

9. CD8T.pdf

10. Mono.pdf

好啦,到这里全部输出文件就介绍完毕了,生信云平台同时提供根据450K和850K两种甲基化芯片的结果进行免疫浸润分析。
看了小云的介绍是不是想要迫不及待地试一下了呢?
450K甲基化数据的免疫浸润分析www.biocloudservice.com/789/789.php
850K甲基化数据的免疫浸润分析www.biocloudservice.com/111_850k/111_850k.php

