每日科研进展l2022.08.07l比较转录组分析显示WSSV IE1蛋白在DNA复制控制起关键作用

对于DNA病毒,早期(IE)蛋白通常是操纵宿主机制以支持病毒复制的重要调节因子。最近,由白斑综合征病毒(WSSV)编码的IE蛋白IE1被证明是一种转录因子。
然而,在病毒感染期间IE1的靶基因仍然知之甚少。在这里,我们利用RNAi结合转录组测序分析探索了IE1的宿主靶基因。

从对虾中共鉴定出429个差异表达基因(DEG),其中284个基因在IE1敲除后上调,145个基因下调。

GO和KEGG途径富集分析显示,已鉴定的DEG在微染色体维持(MCM)复合物和DNA复制中显著富集,表明IE1在DNA复制控制中起着关键作用。

此外,研究发现,凡纳滨对虾MCM复合基因在WSSV感染后显著上调,而RNAi介导的PvMCM2敲除降低了感染早期的病毒基因表达和病毒载量。

最后,我们证明了IE1的过度表达促进了昆虫High Five细胞中MCM复合基因的表达以及细胞DNA的合成。


总的来说,目前的数据表明WSSV IE1蛋白是一种病毒效应子,调节宿主DNA复制机制以进行病毒复制。
原文链接:
https://doi.org/10.3390/ijms2315817