一般公司提交的是初步质控处理过的clean data,最好把raw data一并要过来。一般公司会对数据进行基本的质控,但我们还要再确认一次,为什么呢?个人遇到的情况包括以下几种:
部分样本的接头可能去得不完全
此外,为了数据量好看(更大),一般质量过得去的情况下,公司不会对reads前后端测序质量较低的碱基进行剪切,需要自己根据情况进行处理