可视化绘图软件Multi-omics Visual之PCA图3D绘制
PCA是主成分分析（PrincipalComponents Analysis）的简称，在之前的推文《如何进行PCA分析》中曾经介绍过如何使用R进行主成分的分析，并进行二维PCA图的绘制，这里就不再赘述了。只是，考虑到实际情况中，用户可能有其他方面的需求。比如部分用户在公司测序之后其实拿到的主成分分析的结果，而不是从头分析；更希望通过三维图的方式直观展示结果等。因此，笔者在Multi-omics Visual软件中也加入了一个小功能，可以直接根据PCA分析的结果进行三维图片绘制。
一 PCA图绘制
1、安装好我们的软件之后，首先第0步需要做就是打开软件界面。
随后，将我们的示例文件拖入到软件的‘input file’文本框中。注意，我们这里也提供了excel加载选项，所以也可以直接加载excel文件。加载方法详见之间的推文《可视化绘图软件Multi-omics Visual之韦恩图绘制》。
接着，本软件在绘制图片时，需通过步骤3点击‘Adjustment para(need open when plot)’打开对话框，完成参数配置。注意，因为本软件目前尚未针对3D图提供可调参数，因为目前来看，这种图片的需求似乎并不旺盛（后期可能酌情增加）。
最后，点击‘start’按钮，即可打开韦恩图界面，如图4所示。这里我们可以直接在界面上拖动，调整3D的视角，从而能够得到最佳的展示角度。
二 惯例小结
虽然，目前针对这一功能并未提供更多可调参数。但是，上述的图片在seminar上展示的话应该还是可以的，或者说做一个预展示也还是不错的。至于论文级别的图片展示，用户可以多等几个月，我也在继续尝试完善这一软件的功能（coming soon）。另外，该图不仅可以用于PCA图的绘制，任何三维数据均可以用该点状图表示。
Multi-omics Hammer软件下载地址：
https://github.com/wangjun258/Multi-omics-Hammer
Multi-omics Visual软件下载地址：https://github.com/wangjun258/Multi_omics_Visual/releases/tag/Multi_omics_Visual_v1.03
PS：因为本软件是用python脚本撰写，调用了部分依赖包，用户首次使用需要安装python以及对应的包，安装之后便可永久使用。
本公众号开发的相关软件，Multi-omics Hammer软件和Multi-omics Visual软件欢迎大家使用。文末是本公众号在其他平台的账户，也欢迎大家关注并多提意见。
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另外，怎么说呢，投币也可，不强求，但奢求。
