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正准备做miRNA定量?这个羊毛一定要薅!

2022-07-15 14:57 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

今天要推荐的是来自QIAGEN的一个miRNA荧光定量的惊喜“小礼包”:miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit(货号:339320)

试剂盒包含逆转录试剂、SYBR Green qPCR Mix,还有UniSp6模板及引物,一个候选内源对照引物组引物(miR-103a-3p)和两个经过验证的引物组(可任选2条预制引物哦,物种包含人、大鼠、小鼠),所有试剂均通过LNA技术进行了增强。这些试剂足够定量分析多达20个样品。

关于性能,也是非常厉害的!有图有真相,可以从低至 1 pg 的总 RNA 起始材料进行准确定量!再也不用担心样本量太少没办法定量啦!

图注:显示了来自人 AM6000 总 RNA 的连续稀释的数据。 所有 miRNA 测定均显示线性读数,相关系数 R2 > 0.99。

Tips:我们建议在研究miRNA表达时,选择的内参是内源性内参基因应是稳定表达的miRNAs,而不是较长的RNA物种,如snoRNAs和包括U6在内的snRNAs。这是因为miRNAs较短,在提取和逆转录过程中可能与较长的转录本有非常不同的行为。根据样本的来源,一些常用的参考miRNAs包括:hsa-miR-103a-3p、hsa-miR-423-3p、hsa-miR-191-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-423-5p和hsa-let-7a-5p。

而人工合成的RNA spike-in 在检查miRNA分离、cDNA 合成和 PCR 扩增效率差差异的过程中,可以起到全程监控的作用,可能揭示核酸酶的潜在存在。方法是分别在 RNA 分离和 cDNA 合成之前向样品中添加已知量的 RNA 掺入物,如试剂盒提提到的Unisp6,或RNA Spike-In Kit, For RT。

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