带你了解腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)包装流程
前面小编带大家了解了腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)载体的基因递送过程,相信对AAV有了初步认识。那么AAV是如何包装得到的呢?本期咱们就来了解下AAV 的包装流程。
一、AAV 介绍
腺相关病毒(AAV)属微小病毒科(parvovirus),为无包膜的单链线状DNA 病毒。只有在腺病毒或者疱疹病毒等辅助病毒协助下,宿主才能产生具有感染性的AAV,所以AAV被称作腺相关病毒。典型的AAV2基因组约4800bp,包括2个反向末端重复序列(ITR,145 bp)和两个读码框(ORF)-Rep和Cap(图1)。ITR对合成互补DNA链是必需的;Rep和Cap可以翻译成多种不同蛋白,如AAV 生活周期必需的Rep78、Rep68、Rep52和Rep40以及包膜蛋白VP1、VP2及VP3 等。AAV病毒系统就是用目的基因替换掉Rep和Cap,然后与表达Rep和Cap基因的质粒共转,从而产生包含目的基因的AAV。目前AAV有12种野生型血清型、100多种变体。不同的血清型对组织或器官有着不同的亲和性。由于安全性高、免疫原性小、表达周期久等优点,AAV被认为是目前最适合在体(in vivo)研究基因功能的利器。
图 1、 AAV2 基因组结构示意图
二、整体包装流程
图 2、 AAV 包装实验流程图
三、实验材料
1. AAV包装系统:目的基因表达质粒(过表达、干扰等)pHBAAV-xxx、包装质粒pAAV-RC和辅助质粒pHelper。
2. 菌株:大肠杆菌菌株 Stbl3。用于扩增 pHBAAV-xxx及其包装质粒。
3. AAV病毒的包装细胞株:AAV-293,生长培养基为DMEM + 10% FBS + 双抗(完全培养基)。
四、AAV包装与纯化
1.载体构建
AAV 包装之前需要构建表达目的基因的载体 pHBAAV-xxx。可以自由选择启动子、荧光标记、是否需要Cre 依赖等特点进行定制。质粒构建完成后需要转化后再使用去内毒素质粒试剂盒抽提,要求浓度不低于1μg/μl,A260/280在1.7~1.8。
2.AAV包装
事先准备好用于包装病毒的AAV-293细胞(50-70%的汇合度,无支原体污染)和病毒质粒,转染一个10 cm培养皿,成分如下:
表1、AAV 包装过程中转染一个标准10 cm dish所需要质粒和转染试剂用量
DMEM 需在 37℃水浴中预热,LipoFiterTM转染试剂建议恢复至室温后使用,使用前需摇匀。转染后 6 h 换新鲜培液。
3.AAV收集和纯化
转染后72 h,收集所有的细胞用液氮反复冻融三次收集上清液,然后使用 Benonase酶消化,所得上清用Biomiga品牌纯化柱纯化,所得病毒分装后于-80°C保存。AAV滴度测定采用国际标准对ITR或者WPRE元件进行qPCR绝对定量。
五、AAV 安全使用注意事项
1) AAV 相关实验请在生物安全柜(BL-2 级别)内操作。
2) 操作病毒时请穿实验服,佩戴口罩和手套,尽量不要裸露双手及手臂的皮肤。
3) 操作病毒时特别小心病毒溅出。如果操作时超净工作台有病毒污染,请立即用70%乙醇加1%的SDS溶液擦拭干净。接触过病毒的枪头、离心管、培养板、培养液请用84消毒液浸泡后统一处理。
4) 如需要离心,应使用密封性好的离心管,如有必要请用封口膜封口后离心。
5) 动物注射操作请在生物安全柜内(BL-2 级别)完成。
6) 病毒相关的废弃物需要特殊收集,统一经高温灭菌处理。
7) 实验完毕用洗手液清洗双手。
以上就是AAV包装的具体流程了,如有相关问题或需要构建AAV,欢迎随时与我们联系。