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R语言逻辑回归分析连续变量和分类变量之间的“相关性“

2021-06-15 19:21 作者:拓端tecdat  | 我要投稿

原文链接:http://tecdat.cn/?p=18169

原文出处:拓端数据部落公众号

 

比如说分类变量为是否幸存、是因变量,连续变量为年龄、是自变量,这两者可以做相关分析吗?两者又是否可以做回归分析?

我们考虑泰坦尼克号数据集,


  1. titanic = titanic[!is.na(titanic$Age),]

  2. attach(titanic)

 考虑两个变量,年龄x(连续变量)和幸存者指标y(分类变量)


  1. X =  Age

  2. Y =  Survived

 年龄可能是逻辑回归中的有效解释变量,

  1. summary(glm(Survived~Age,data=titanic,family=binomial))


  2. Coefficients:

  3. Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)

  4. (Intercept) -0.05672 0.17358 -0.327 0.7438

  5. Age -0.01096 0.00533 -2.057 0.0397 *

  6. ---

  7. Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1


  8. (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)


  9. Null deviance: 964.52 on 713 degrees of freedom

  10. Residual deviance: 960.23 on 712 degrees of freedom

  11. AIC: 964.23

 此处的显着性检验的p值略低于4%。实际上,可以将其与偏差值(零偏差和残差)相关联。

在x毫无价值的假设下,D_0趋于具有1个自由度的χ2分布。我们可以计算似然比检验的p值自由度,


  1. 1-pchisq(

  2. [1] 0.03833717

 与高斯检验一致。但是如果我们考虑非线性变换

  1. glm(Survived~bs(Age)


  2. Coefficients:

  3. Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)

  4. (Intercept) 0.8648 0.3460 2.500 0.012433 *

  5. bs(Age)1 -3.6772 1.0458 -3.516 0.000438 ***

  6. bs(Age)2 1.7430 1.1068 1.575 0.115299

  7. bs(Age)3 -3.9251 1.4544 -2.699 0.006961 **

  8. ---

  9. Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1


  10. (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)


  11. Null deviance: 964.52 on 713 degrees of freedom

  12. Residual deviance: 948.69 on 710 degrees of freedom

Age的p值更小,似乎“更重要”


  1. [1] 0.001228712

为了可视化非零相关性,可以考虑给定y = 1时x的条件分布,并将其与给定y = 0时x的条件分布进行比较,


  1. Two-sample Kolmogorov-Smirnov test


  2. data: X[Y == 0] and X[Y == 1]

  3. D = 0.088777, p-value = 0.1324

  4. alternative hypothesis: two-sided

 即p值大于10%时,两个分布没有显着差异。


  1. v= seq(0,80

  2. v1 = Vectorize(F1)(vx)

 

我们可以查看密度

 

另一种方法是离散化变量x并使用Pearson的独立性检验,


  1. table(Xc,Y)

  2. Y

  3. Xc 0 1

  4. (0,19] 85 79

  5. (19,25] 92 45

  6. (25,31.8] 77 50

  7. (31.8,41] 81 63

  8. (41,80] 89 53


  9. Pearson's Chi-squared test


  10. data: table(Xc, Y)

  11. X-squared = 8.6155, df = 4, p-value = 0.07146

 p值在此处为7%,分为年龄的五个类别。实际上,我们可以比较p值

  1. pvalue = function(k=5){

  2. LV = quantile(X,(0:k)/k)



  3. plot(k,p,type="l")

  4. abline(h=.05,col="red",lty=2)

 

 

只要我们有足够的类别,P值就会接近5%。实际上年龄在试图预测乘客是否幸存时是一个重要的变量。

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