SCI作图进阶版GraphPad绘图技能2.0:IC50的log转化技巧

今天给大家分享一个,用GraphPad绘制IC50浓度梯度等距排列的技巧。
首先展示一篇Nature上的样图。与直接在横坐标上输入0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100不同的是,X轴上实现浓度梯度等距排列,需要先进行log转化。

老规矩,咱们还是“四步走”!
STEP 1
首选我们需要创建一个XY的表格形式,选择输入XY轴数据。

STEP 2
输入log10转化后数据。以0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100为例,log10转化后对应-3, -2, -1, 0, 1, 2,因此我们可以在X轴上对应着输入转化后的数值。

STEP 3
选择绘制线图,Y轴起始大小设为X轴的最小值(这里是-3)。


STEP 4
设置X轴格式,因为X轴中的数字是经过log10计算的,因此在Regularly spaced ticks-Number format里选择Antilog,即可获得X轴的浓度梯度值。


到这里,一个浓度梯度等距排列的折线图就完成啦。当然,我们还可以继续设置次刻度标记,来丰富X轴中的内容。
注意,次刻度标记也要勾选log哦!


整个操作还是非常简单便捷的。为了使大家更好地理解,我们以个性化的数据为例:首先将X轴(浓度)的数据进行log10转换并输入到对应的表格中,Y轴不变。然后对横坐标进行antilog设置后,就可以生成浓度梯度等距排列的效果了。


