Cre-loxP重组酶系统应用全攻略
Cre-loxP重组酶系统应用全攻略
Cre-loxP重组酶系统
Cre-loxP系统是一种重组酶系统,能在DNA特定位点上执行删除、插入、易位及倒位,是一种广泛应用的基因编辑工具,可以达到在基因水平上对生物体进行定向遗传改造的目的,在真核和原核系统中均适用。
Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)
是由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,全长1029bp(EMBL数据库登录号X03453),编码由343个氨基酸组成的38kDa蛋白。Cre重组酶是一种位点特异性的DNA重组酶,能特异识别loxp位点,介导loxp位点间的序列删除或重组。
loxP位点
locus of X-over P1来源于噬菌体P1,是一段长度为34bp的DNA序列,包括两个13bp的反向重复序列和一个不对称的8bp间隔区组成。反向重复序列是Cre重组酶的特异识别位点,而间隔区域决定了loxP位点的方向。其序列如下:
ATAACTTCGTATA - NNNTANNN - TATACGAAGTTAT
(N 表示碱基可能发生变化)
Cre-loxP系统作用方式
Cre重组酶介导两个LoxP位点间的重组是一个动态、可逆的过程,可以分成三种情况:
1、如果两个LoxP位点位于一条DNA链上,但方向相反,Cre重组酶能导致两个LoxP位点间的序列翻转;
2、如果两个LoxP位点位于一条DNA链上,并且方向相同,Cre重组酶能有效切除两个LoxP位点间的序列;
3、如果两个LoxP位点分别位于两条不同的DNA链或染色体上,Cre酶能介导两条DNA链的交换或染色体易位。
图1.Cre-loxP诱导基因重组的方式
另外,Cre不仅可以识别LoxP的2个13bp的反向重复序列和8bp的间隔区域,而且当一个13bp的反向重复序列或者8bp的间隔区发生改变时仍能识别并发生重组。利用这一特点,人们在构建载体时可以根据需要改造LoxP位点序列,以用于特定的基因突变或修复,增加了该系统的应用范围。
Cre-loxP重组系统在转基因中的应用
Cre-loxP重组系统的优势,主要体现在:时空特异、高效性、准确性、快速性。由于Cre-loxP重组系统的高效简单的作用方式,它已成为体内外DNA重组的有力工具。
图2.Cre-loxP重组系统在转基因中的应用
应用Cre-loxP重组系统较为常见的形式是两种转基因动物的杂交。
(1) 通过转基因动物办法获得一只“Cre小鼠”或“floxed小鼠”;
(2) 病毒注射“Cre小鼠”或“floxed小鼠”,引入loxP或Cre重组酶元件。
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