生信高级图大赏之富集分析热图

上期给一位好学的网友介绍了基因&通路关联网络图之后，我们乘胜追击，继续给大家介绍富集分析的新样式。

一、介绍

来欣赏一下这个图：

这货乍一看是不是有点像二维码？但它可扫不了，因为它是一个半吊子（bushi）。

其实，它也是一种热图，是不是觉得不可思议？我们通常见到的热图都是密集排列的，哪会出现这么大的空隙呢？确实，同为热图，但它似乎却没那么“热”，因为它展示的只是基因和通路的关系，而通路中包含的基因不尽相同，比如这个基因在某条通路中存在，但是在另一条通路中却未必存在，所以排列的结果就变成了稀疏和零散的样子。此“热图”非彼“热图”。

那这种甚至有点“冷”的热图有何用途呢？

有时候，如果我们希望显示大量重要的通路，那么基因&通路关联网络图可能会变得过于繁杂且不美观，而热图可以简化结果，更容易识别表达模式，更直观地展示所选基因和通路之间的关系以及基因的表达倍数变化。

介绍到这里，我们再来简单聊聊怎么去实现。

是它，就是它：enrichplot！

没想到吧？还是这个R包，就是这么强大！它内置了各式各样的函数，简直快要把生信天下的图一网打尽。上述的热图就涉及到其中的一个函数：heatplot。

好家伙！敢情热图的“热”是“heat”翻译而来的？

当然了，三要素（通路、基因和差异表达倍数）肯定少不了，把这三要素变成二进制的矩阵关系即可出图。至于美化的功能，你想要的，它都有。

二、图解

纵坐标：表示功能富集通路；

横坐标：表示通路中的基因；

渐变颜色柱：通路中存在的基因则会显示颜色柱，渐变颜色表示基因的表达倍数变化。

三、应用

显然，根据富集分析热图的内涵，转录组、蛋白质组和代谢组等研究数据的应用自然不在话下。

好啦！今天的介绍就到这里，感兴趣的朋友们可以去试试。