Olex2结构精修时信息无法写入CIF的解决方案

 

有时候在使用Olex2进行结构精修的时候，在Olex2操作界面填入的信息无法写入CIF文件。案例如下。

 

晶体数据所在文件夹文件情况如图1所示：

 

Olex2中Report>>Source Files中也正确读取晶体参数文件cif_od（理学单晶衍射仪记录仪器信息、晶胞参数等信息的文件），如图2所示。

 

在Report>>Crystal中填入了晶体描述（plate），以及绝对结构确定方法（Anomalous dispersion），如图3所示。

 

然而在调用PLATON进行结构验证（Structure Validation）时，却出现了如图4所示的AB类警报。

 

打开CIF文件，发现很多信息的参数缺失，全都是问号，如图5–6所示。

 

对于这种情况，可以点击如图7所示的Merge CIF按钮。

 

点击Merge CIF按钮后，Olex2界面左下角提示“All 21 conflicts have been resolved”，并且自动打开CIF，可以看的，CIF中那些原来是问号的条目均已填上相应的信息，如图8–10所示。

 

 

此时关闭CIF文件。

 

千万不要精修！

 

千万不要精修！

 

千万不要精修！

 

因为精修就会产生新的CIF文件，并把已填好信息的CIF文件给覆盖掉。

 

关掉CIF文件后，直接调用PLATON进行结构验证，则之前出现的AB类警报已消失，如图11所示。

 

如果还需要进行精修，那么在精修全部完成后，点击Merge CIF按钮，点完后就不要再精修了，点完Merge CIF按钮产生的CIF文件就是最新的已经解决问题的最终CIF文件。

 

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