干货|单细胞核RNA测序内测数据大放送
单细胞核RNA测序(snRNA-seq)的优势
1)冷冻组织可以用于直接抽提细胞核,为临床回顾性研究中单细胞测序的开展提供了解决方案。2)有些组织通过酶解消化很难拿到高质量的细胞悬液,通过抽提细胞核,避开酶解消化,是一个更好的选择。3)适用于对解离酶敏感(如神经元、肝实质细胞)、直径较大、形状不规则(如心肌细胞)等特殊细胞类型。4)直接从组织抽提细胞核,不需要酶解消化及恒温孵育,避免了组织解离过程中诱导应激基因的表达。
伯豪生物丰富的单细胞核抽提经验
利用自主研发的“伯优细胞核分离试剂盒”已经完成大脑皮层、下丘脑、海马、延髓、松果体、肝脏、心脏、胶质瘤、骨、乳腺和胰腺等20多种组织的抽核制备及上机测序。
伯豪生物snRNA-seq内测数据展示
1)脑组织
脑组织snRNA-seq各种细胞类型比例:神经元(Neurons)73.0%;星形胶质细胞(Astrocytes)9.4%;少突胶质细胞(Oligodendrocytes)9.2%;内皮细胞(Endothelial cells)6.7%;小胶质细胞(Microglial cells)1.4%及嗅鞘胶质细胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。
2)心脏组织

心脏组织snRNA-seq各种细胞类型比例:心肌细胞(Cardiomyocytes)38.8%;内皮细胞(Endothelial cells)30.3%;成纤维细胞(Fibroblasts)16.6;神经元细胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬细胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;间皮细胞(Mesothelial cells)0.6%;T和B细胞分别占0.4%;中性粒细胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪细胞(Adipocytes)0.2%及髓细胞(Myeloid cells)0.1%。3)肝脏组织

肝脏组织snRNA-seq各种细胞类型比例:肝细胞(Hepatocytes)56.0%;内皮细胞(Endothelial cells)10.9%;胆管细胞(Cholangiocytes)9.4%;成纤维细胞(Fibroblasts)9.2%;星状细胞(Stellate cells)8.7%;T细胞4.7%及B细胞1.1%。