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十分钟轻松拿下4.7 +SCI生信分析套路,拿捏SEER数据库,再也不为文章发愁!

2023-06-24 19:00 作者:生信鸟  | 我要投稿

前几天师妹问我哪里来的写作思路?

其实……

是因为我关注了生信鸟!

这里有新鲜出炉的生信热点方向、还有大家关心的最新文献套路解读····

提起热点,布小谷就不得不提最近在PubMed里看到的一篇文章,只有简简单单五张图,便斩获了4.7+高分SCI。这篇文章乍一看很easy,主要是借助SEER数据库进行了KaplanMeier生存分析,但是布小谷细细解读后发现文章里其实暗藏玄机ps:一篇文章的好坏,主要是看他的观点是否新颖独到、逻辑是否流畅通顺、分析方法是否别具一格),具体如何做到高分接收呢,请听布小谷细细道来~~~

首先是题目,作者借助了一个疑问句引起了读者的兴趣并诱发了读者的思考。作者创新性的发现淋巴结转移阴性患者经常被排除在晚期鼻咽癌的各种临床试验外这类患者化疗的生存获益一直存在争议,以此为研究背景,借助了SEER数据库,探讨化疗对局部肿瘤晚期患者的益处(ps:此方向研究少创新度较高,是文章的一大亮点),并深化评估了淋巴结转移阳性、淋巴结转移阴性患者单纯放疗与放化疗对生存期的影响。主旨鲜明,条理清晰,再加上作者借助了PSM对数据进行了匹配,减少了偏倚,较为严谨。整个文章数据量不大但创新性很高,因此拿下4.711分的SCI名副其实(ps:有什么热点想让布小谷安排可以留言给布小谷,带大家一起飞!)

l 题目:局部进展期鼻咽癌的化疗:谁真正需要化疗

l 杂志:cancer medicine.

l 影响因子:IF=4.711

l 发表时间:2023年3月

研究背景

鼻咽癌全国新诊断鼻咽癌6.24万例,死亡3.48万例鼻咽癌治疗手段以放疗和化疗为主,对于局部进展期鼻咽癌,已有许多研究证明放疗联合化疗可提高生存率和局部控制率一些局部区域晚期鼻咽癌的临床研究排除了淋巴结阴性的患者因此,在监测的基础上进一步探讨局部进展期鼻咽癌的疗效及预后因素具有重要意义。

数据来源

从SEER数据库中共提取2741例患者。经过1:1双重差分倾向得分匹配分析后,筛选出272例患者评估单纯放疗以及放化疗对OS和CSS的影响。作者将患者分为淋巴结阳性及淋巴结阴性亚组,更为精准的描述了单纯放疗组与放化疗组KaplanMeier生存结果

主要结果

1.PSM前后单纯放疗组与放化疗组倾向评分分布

作者共纳入来自SEER数据库的2741例III-IVB期NPC患者,分组后作者发现发现年龄较小、病理分级较高、淋巴结阳性的患者更容易接受放化疗联合治疗,两组数据显著不平衡(图1A、1B),这不可避免地导致了选择偏差。因此,作者采用PSM方法进行匹配,比较匹配后单纯放疗组与放化疗组倾向评分分布,结果可见,两组间评分趋于相似(图1C、1D)。(ps:这里作者较为创新的引用了PSM匹配,PSM是一种平衡预处理协变量,有效降低混杂偏倚,从而使观测数据得到的结果更为可靠的分析方法。)

图1PSM前后单纯放疗组与放化疗组倾向评分分布

2.PSM前后单纯放疗组与放化疗组临床特征差异分析

接下来,作者比较了匹配前后单纯放疗组与放化疗组的临床病理特征,结果可见,匹配后的136对患者的临床病理特征差异显著减小,所有协变量平衡(图2)。(ps:在进行预后分析之前,作者比较了两组患者的临床特征差异,确定协变量平衡后进行下一步分析,以降低结果偏倚的可能性,这么“高大上”的操作小伙伴们还不快快学习起来?)

图2两组间各协变量的标准差

3. PSM后患者的OS和CSS评估

之后,作者对PSM后匹配人群进行Kaplan-Meier分析,发现接受放化疗的患者有更高的OS和CSS(图4)。(ps:作者评估了两种治疗手段的生存结局,OS、CSS是常见的预后评价指标,小伙伴们也可以补充无病生存期DFS等指标进行评估完善内容。大家有什么疑问或者热点都可以联系生信鸟公众号,布小谷会认真阅读并为大家安排解读哦。)

图3PSM后III-IVB期NPC患者OS和CSS的Kaplan-Meier曲线

4. 淋巴结阳性III-IVB的NPC患者OS和CSS的Kaplan-Meier曲线

之后,作者将患者分为淋巴结阳性及淋巴结阴性亚组,更为精准的描述了单纯放疗组与放化疗组KaplanMeier生存结果。结果表明,对于淋巴结阳性III-IVB NPC患者来讲,放化疗组的OS、CSS明显高于单纯放疗组4B)(ps:这里体现了作者的逻辑性。之前已经评估了患者OS和CSS,为了深入探讨患者的生存,作者将患者细分为了淋巴结阳性及淋巴结阴性两个亚群,分别进行了生存评估,使文章逻辑更为严密,内容更为丰富)

图4 淋巴结阳性III-IVB的NPC患者OS和CSS的Kaplan-Meier曲线

5. 淋巴结阴性III-IVA的NPC患者OS和CSS的Kaplan-Meier曲线

在评估淋巴结阳性III-IVB的NPC患者OS和CSS生存后,作者描述了淋巴结阴性III-IVA的NPC患者单纯放疗组与放化疗组KaplanMeier生存结果。结果发现,

与单独放疗相比,放化疗没有OS或CSS获益4A、4B)(ps:这里体现了作者的创新性。由于目前细化为淋巴结阴性的NPC生存探讨尚未明确,因此作者创新性的分析了淋巴结阴性的NPC患者的生存结局,小伙伴们在写文章的时候一定要认真研读相关背景,如果对于现有局限性提出了补充,文章质量将会大大提高。)

图5淋巴结阴性III-IVA的NPC患者期OS和CSS的Kaplan-Meier曲线

文章小结

这篇文章在思路的选择上比较新颖,关注了以往文章常常忽略的淋巴结阴性III-IVANPC群体,此外利用了PSM法对数据进行了匹配后进行了生存分析,增加了结果的可信度。即使分析内容简单,数据量不是很大,但是逻辑通顺,结构严谨,环环相扣,发到4.711分+绝对名副其实!!学会了的小伙伴们赶紧打开电脑复刻吧!


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