生物信息培训计划（芯片分析，文献阅读）
最近很多同学咨询未来的教程更新计划，在这里我做了一个第一阶段的培训计划，感兴趣的同学可以关注我们，课程将持续更新。
做培训的初衷是因为本组的本科生基础差（二本） ，需要生信相关的培训，而国内生信领域相关视频培训教程质量参差不齐。现有的生信培训课程主要有三种：
（1）个人爱好主要是科普性质，视频短，课程不成体系，复杂问题说不清楚，对于学习生物信息这种交叉学科，可以说略胜于无；
（2）大学的生信课程，中国大学的课程特点是废话多，干货少，听课效率差，没有代码演示，听完课也没有可操作性；国外大学的课程课程内容很好，但是全英文授课对中文环境下的初学者来说难度太大；
（3）培训机构课程，企业或者培训机构的培训通常是收费课程或者公益课程，具体操作讲的多，原理讲的少，没有基础很难理解，同时很多收费课程都是由个人录像发到B站，这种自己转发的课程存在法律风险，随时可能下架（参考我的收藏夹，里面很多课程看着看着就下架了）。
这种情况下，本课题组希望结合正在做的科研项目，开发一套开源的生信课程让更多热爱计算机，热爱生物医学的同学可以有效的学习生物信息知识。课程中有我们的自制内容也有B站其他UP的创作，衷心感谢乐于分享知识的UP们，也希望课程能帮助到热爱科研的你。我们既不是专家学者，也不是大的科研团队，只有一个老师和十几个学生基于生物医学和工学专注于转录调控过程和癌症机制和临床应用研究。我们的课程最大的特点是可操作性，尽量保证你能理解课程中涉及的到大量生物医学，计算机，统计学概念，并复现课程中的代码和实例。如果有疑问可以在评论区留言，我们尽量回复。教程更新速度不会太快，但绝对保证课程质量。
目前第一阶段（主要是解决二本学生生信入门的问题）的更新计划如下：
一、JAVA WEB 开发学习路线
1、前端
HTML5基础
https://www.bilibili.com/video/BV1x4411V75C/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
CSS3基础
https://www.bilibili.com/video/BV1YJ411a7dy/?spm_id_from=333.999.0.0
JS+JQuery基础
https://www.bilibili.com/video/BV1JJ41177di/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
Bootstrap
https://www.bilibili.com/video/BV1TU4y1p7zU/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
帝国CMS(万能标签)
https://www.bilibili.com/video/BV1vS4y1j7Hi/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
项目实训（信息发布类网站）
2、JAVA基础
JDK安装，IDEA使用，注释，标识符，数据类型，常量变量，运算符，包，Scanner，顺序结构，IF分支结构，Switch选择结构，While, dowhile，for循环结构，方法，递归，数组。
https://www.bilibili.com/video/BV12J41137hu/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
3、JAVA进阶
注解反射
https://www.bilibili.com/video/BV1p4411P7V3/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
MySQL
https://www.bilibili.com/video/BV1NJ411J79W/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
4、JAVA WEB
JAVA WEB 开发
https://www.bilibili.com/video/BV12J411M7Sj/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
mybaits
https://www.bilibili.com/video/BV1NE411Q7Nx/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
蓝桥杯
5、JAVA开发框架；
Spring5
https://www.bilibili.com/video/BV1WE411d7Dv/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
spring MVC
https://www.bilibili.com/video/BV1aE41167Tu/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
SpringBoot
https://www.bilibili.com/video/BV1PE411i7CV/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
VUE
https://www.bilibili.com/video/BV18E411a7mC/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
项目实践
SpringCloud
https://www.bilibili.com/video/BV1jJ411S7xr/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
阿里微服务架构
6、数据可视化
echart/highchart
https://www.bilibili.com/video/BV1Uz4y1S7kr/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
7、服务器运维
Docker
https://www.bilibili.com/video/BV1og4y1q7M4/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
二、低通量分子生物学实验
1、生物学的发展阶段
2、中心法则
3、分子生物学相关概念
4、分子生物学实验
（1）Southern bolt analysis（DNA）
（2）Northern blot analysis（RNA）
（3）Western blot analysis（protein）
（4）Polymerase Chain Reaction（PCR）
（5）免疫荧光技术（IF）
（6）免疫组织化学（IHC）
https://www.bilibili.com/video/BV1D54y1N7Bv/
三、高通量生信实验
1、芯片数据分析
1、基因芯片简介 2、如何制作基因芯片 3、基因芯片厂商 4、芯片种类 5、基因芯片数据获取 6、基因芯片数据分析 7、基因芯片探针注释 8、差异计算 9、差异基因图绘制 10、GO富集，KEGG富集
https://www.bilibili.com/video/BV1424y157MR/
2、转录组测序
即将更新
3、单细胞测序
即将更新
4、单细胞多组学数据整合
即将更新
5、空间转录组
即将更新
四、R数据分析
1、R语言基础 ；
2、ggplot2画图；
3、差异基因计算；
4、R语言富集分析；
5、GSEA富集分析；
、R统计分析分析；
7.1 SCI论文思路举例；
7.2 KM批量分析；
7.3 COX回归；
7.4 LASSO回归；
7.5 ROC曲线和生存曲线检测；
https://www.bilibili.com/video/BV1sF411j7JY/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
五、Python数据分析
即将更新
六、linux教程
Linux基础
https://www.bilibili.com/video/BV1HY4y1B7Ts/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
虚拟机/子系统安装
https://www.bilibili.com/video/BV1Ze411N7NR/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
Linux基本命令
shell编程
云计算
conda
七、文献检索和阅读
（一）文献分类
（二）文献获取
（三）论文结构
（四）论文阅读
https://www.bilibili.com/video/BV1wj411X7Pm/
八、科研作图
即将更新
九、专创融合
创新创业课程设计+大创项目申报
https://www.bilibili.com/video/BV1Ss4y1Y7wQ/?spm_id_from=333.999.0.0&;;vd_source=ba2248623e770d6a79d500dbbe961230
