SAGAR计算平台介绍

       为了降低材料计算软件的使用门槛、提升多组元材料筛选效率，我们开发了基于结构识别的高通量第一原理计算程序 Structures of Alloys Generation And Recognition (SAGAR），从最初的命令行到网页版，从输入文件准备到自动化计算和数据库的生成，SAGAR已经逐渐成为方便的材料计算平台。在同行使用和反馈的基础上，我们将逐步完善相关功能。 

       SAGAR平台以VASP为例，通过模板化的输入文件，使用户可以选择最少的参数得到合理结果，从而有效降低使用门槛。第一原理计算包括确定结构、软件使用、硬件算力、数据处理等四个环节，而SAGAR平台将后三者整合，平台对接是VASP计算程序，硬件算力由合作伙伴（景派科技、并行科技等）提供；只需要用户确定输入的结构文件，可以实现自动化计算后，计算总能、能带、声子谱、PDOS、过渡态、合金结构等，通过数据库查看，简单方便。

       用户登录后，可以在“结构输入”区域贴入需要计算的结构（VASP的POSCAR格式）。对于晶体结构，可以通过相关的数据库网站（如AFLOW等）下载文件；对于分子结构，可以通过Avogadro免费软件得到xyz文件，并进一步转化格式；对于合金结构，可以通过SAGAR网页版生成不等价结构。

       点击“结构优化”的submit按钮即可提交计算。计算结束后，可以在数据库找到对应链接，打开查看对应的结构、能量、计算参数等信息。

      平台默认是体材料的优化，晶格参数和原子位置同时优化（对应VASP的ISIF=3）。如果体系是孤立分子或者团簇，k点网格用1x1x1即可，对应的是kpts=1,1,1，而晶格常数不需要优化，ISIF=2。具体需要在submit前面对话框输入如下：

       一般计算中，影响精度和速度的主要参数是截断能大小和k点划分密度。建议截断能测试从最小值200到最大值700，间隔区50或者100均可；建议k点划分密度从最小值500到最大值5000，间隔在500左右即可。一般选择体系能量开始趋于平稳时对应的较小的截断能、k点划分密度即可，保证精度并提供速度。

      在电子结构方面，通常需要计算能带、DOS等，这里可以根据需要勾选需要的文件，计算完成后，在相应的数据库中查看或者下载。